根据《中华人民共和国土地管理法》第七十六条(2004修正版)和《中华人民共和国土地管理法实施条例》第四十二条(2014版)的规定，决定处罚如下:
1.收回已批准的国有土地 53.093亩(折35395.6平方米)纳入政府储备;
2.没收在违法占地上建筑物6813.34平方米(扣除已办理房地产权证面积)及其他设施;
3.处以每平方米 10 元罚款，共计 353956 元。