亳州市华佗中医院系谯城区唯一一家区级公立医院，始建于1956年，2000年获批“二级甲等中医医院”，是安徽省“北华佗、南新安”中医发展战略重点建设单位，全国基层中医药工作示范区创建单位，国家中医药管理局中医药传承创新示范试点项目建设单位，是全省首家开通低空医疗航线的县级医院。2024年9月被省卫健委批准设置为三级中医院。医院现有州后街院区和西院区两个院区，总占地面积150余亩，建筑面积6万㎡，开放床位500张。设置门诊科室23个，临床科室16个，医技科室8个。医院在职职工总数525人，其中硕士及以上学历31人，中高级职称242人。年门急诊40万人次，出院2.2万人次，我院是医共体牵头医院之一，辖8个乡镇卫生院、1个社区卫生服务中心，99个村卫生室，覆盖参保人口40.7万人。

医院现有全国第五、第六届名老中医药学术经验传承指导老师1人，华佗五禽戏58代传承人1人，省级名中医1人，市级名中医8人，市级青年名中医1人。拥有国家级非物质文化遗产华佗五禽戏传承工作室1个，安徽省名中医工作室2个、江淮名医、青年岐黄学者工作室各1个，省级流派工作室1个，名老中医工作室1个，市级名中医工作室8个。拥有脑病科、肺病科、骨科、妇科四个市级重点专科。老年医学科获批省级规范化老年科，针灸科、康复科申报市级重点专科，骨科申报省级重点专科。电子病历达到4级水平，互联网医院已报省级审批。医院寇氏妇科是安徽省首批传承创新流派之一，发源于名老中医寇瑞庭（1894-1991），其第四代传承人李献华获评安徽省名中医。

医院始终坚持政府办医公益性方向，积极践行公立医院责任担当，建有全区中医适宜技术推广中心、基层中医人才提升工程培训基地、全区康复治疗中心、区域治未病中心、区域转会诊中心和区域急救站点，是全区艾滋病、结核病、丙肝等重大传染病救治定点医院。医院坚持“中”字为本，依托华佗中医院健康管理服务公司，筹建区域大健康管理中心，将华佗“治未病”思想与现代健康管理结合，推动华佗品牌生活化，推出中医美容、减重、助眠、亚健康管理和儿科推拿等特色门诊，开展中医特色诊疗技术60余种，院内制剂备案13种，已生产调脂保肝颗粒、枳连清胃颗粒、参归脑络通颗粒3个品种，开发院内协定方、特色茶饮如四季养生茶等16种。

医院始终高度重视华佗医学传承发扬，先后成功承办三届全国（国际）华佗学术研讨会，收集整理相关学术论文423篇，参与编纂《华佗医学》、《华佗研究集成》是国内研究华佗医学的重要文献。医院不断推动华佗医学创新性发展，先后主编出版《寇瑞庭验方脉案集》、《杨从鑫名老中医临床经验文集》等著作，主编的《华佗五禽戏》纳入国家体育局推广教材，编创的适合中医临床应用的五禽戏健身功法，被中国医学气功学会列为推荐功法向海内外推广，成为华佗中医药文化国际传播的一张亮丽名片。